有人曾這樣形容：“掌握了一個生物保藏庫，就相當于掌握了一大批工廠。”如今的中科院微生物研究所(以下簡稱微生物所)，無疑就擁有這樣一個世界級的寶庫。

記者近日從微生物所獲悉，落戶在該所的國家微生物科學數(shù)據(jù)中心牽頭建設(shè)的全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺已經(jīng)匯聚了來自51個國家141家合作伙伴的52萬株微生物實物資源數(shù)據(jù)。“這說明作為全球最大的綜合性微生物研究機構(gòu)，微生物所正在國際合作中承擔更多責任。”微生物所所長錢韋在接受《中國科學報》采訪時說。

“共享平臺使我國科學家能以全球視野組織、協(xié)調(diào)各國相關(guān)力量，建立全球性的合作框架。同時，也推動著中國逐步在微生物資源的開發(fā)應(yīng)用和數(shù)據(jù)共享方面占據(jù)國際微生物研究前沿和主導地位。”全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺負責人、國家微生物科學數(shù)據(jù)中心主任馬俊才表示。

聚合資源 互聯(lián)互通

作為一家有著60年所齡的研究機構(gòu)，微生物所“家底”不少，其中之一就是傳承了幾代人的“微生物銀行”——中國普通微生物菌種保藏管理中心。

“這是國內(nèi)第一個通過國際標準化組織(ISO)認證的保藏中心，也是全球最大的微生物資源庫之一。”錢韋介紹，該中心現(xiàn)保藏的實物菌種資源總量超過8萬株，已成為我國重要科學研究和微生物資源的寶庫。

家有梧桐樹，引得鳳凰來。2010年，經(jīng)過全球激烈競爭，世界微生物數(shù)據(jù)中心落戶微生物所。11年來，全球共有77個國家的812個微生物資源保藏中心在該中心注冊，成為我國“盤點”全球微生物及其遺傳資源的重要平臺。

國家微生物科學數(shù)據(jù)中心是2019年20個首批啟動的國家級科學數(shù)據(jù)中心之一，微生物所為牽頭單位，使我國微生物資源相關(guān)的一系列重要數(shù)據(jù)庫進一步完善。

作為一名大數(shù)據(jù)研究領(lǐng)域的專業(yè)“選手”，彼時馬俊才同時肩挑世界和國家微生物科學數(shù)據(jù)中心負責人兩個職位。但他還有更大的決心——解決長期以來全球微生物資源數(shù)據(jù)平臺存在的各國數(shù)據(jù)分散、用戶無法一站式檢索的問題。

于是，國家微生物科學數(shù)據(jù)中心和世界微生物數(shù)據(jù)中心牽頭建立了全球微生物菌種保藏目錄國際合作計劃，搭建了全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺，匯聚了來自51個國家141家合作伙伴的52萬株微生物實物資源數(shù)據(jù)，形成了全球互聯(lián)互通的微生物數(shù)據(jù)信息化合作網(wǎng)絡(luò)。

在錢韋看來，這個平臺就像一個“通天塔”，通過這個體系，中國可以組織和協(xié)調(diào)各國研究力量，建立全球性合作框架，在微生物資源整理整合和數(shù)據(jù)共享方面發(fā)揮引領(lǐng)和主導作用。

制定標準 引領(lǐng)國際

在近期舉行的2021年世界互聯(lián)網(wǎng)大會烏鎮(zhèn)峰會上，全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺入選首屆全球12項“攜手構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)空間命運共同體精品案例”。“這對我們是很大的鼓勵。”馬俊才認為，所謂的“網(wǎng)絡(luò)空間命運共同體”本質(zhì)是通過國際合作讓所有參與者都能從中受益。

據(jù)介紹，該共享平臺免費開放，所有微生物數(shù)據(jù)向全世界共享。“相當于全世界不同國家的微生物在一個統(tǒng)一的平臺上‘展銷’。”馬俊才說，它可以讓發(fā)展中國家的微生物保藏中心和資源更好地得到全球的關(guān)注，提高知名度;對于發(fā)達國家來說，它可以提供其評價體系中強調(diào)的微生物資源對全世界所作的貢獻。

馬俊才以歐洲最大的保藏中心——德國微生物菌種保藏中心的菌種在全球使用情況為例解釋道，數(shù)據(jù)平臺可以清晰顯示出1987年以來，全世界用戶用該中心的菌種發(fā)表了多少文章，從而了解該中心在全世界的影響力。

“這樣的系統(tǒng)評價報告現(xiàn)在由我們出，我們的數(shù)據(jù)庫具有權(quán)威性、完整性。”馬俊才說，“就像身份證一樣，凡是進入全球微生物資源保藏中心注冊數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的微生物資源，都有唯一編號和標識符。”

為了打造高質(zhì)量國際性數(shù)據(jù)平臺，國家微生物科學數(shù)據(jù)中心聯(lián)合10多個國家相關(guān)領(lǐng)域的專家，共同制定了國際微生物資源領(lǐng)域的第一個ISO微生物資源數(shù)據(jù)標準，消除了長期以來由于各國微生物資源中心數(shù)據(jù)管理的形式不同帶來的共享阻礙。

不僅如此，國家微生物科學數(shù)據(jù)中心還啟動了全球萬種微生物模式菌株測序計劃，目前已有16個國家的25個微生物保藏機構(gòu)參與到這一國際合作計劃中，并提供了DNA或菌株資源，這使全球數(shù)據(jù)資源共享真正發(fā)展成為國際微生物實物資源的合作。

目前全世界科學家已發(fā)表的模式細菌有17800種，其中已經(jīng)測序的僅有8000種，完成對其余模式細菌的測序正是研究團隊的目標。馬俊才透露，目前這一引領(lǐng)項目已完成4000多種模式微生物的測序。

虛實結(jié)合 打造高地

“我們既擁有世界的，也擁有國家的數(shù)據(jù)庫，這兩套體系是我們在微生物資源研究和對外合作交流方面的一個極大優(yōu)勢。”錢韋說。

談起對數(shù)據(jù)中心未來的期待，錢韋希望，它可以在數(shù)據(jù)科學的核心算法方面取得突破，解決相關(guān)的“卡脖子”問題;推進虛擬數(shù)據(jù)與實物保藏的聯(lián)動，打造微生物領(lǐng)域的“物聯(lián)網(wǎng)”，以數(shù)據(jù)帶動知識體系和實物資源體系的發(fā)展;在微生物數(shù)據(jù)方面培養(yǎng)出世界級科學家。

“正是在中國政府、中科院和微生物所的大力支持下，數(shù)據(jù)中心才有今天的面貌。”馬俊才說，得益于這些支持，中心每年都會舉辦國際研討會、培訓班，甚至還走出國門，把相關(guān)會議和培訓延伸到了國外，在拓展國際合作中起到了很好的作用。

馬俊才表示，下一步，全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺將進一步吸引國際伙伴加入到這一合作網(wǎng)絡(luò)，構(gòu)建國際上最大、最權(quán)威的微生物識別平臺;進一步開展數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用，助力病原微生物防控決策，利用微生物支撐產(chǎn)業(yè)發(fā)展。他們還將繼續(xù)推進萬種微生物模式菌株測序計劃，以完善和重構(gòu)生命系統(tǒng)發(fā)育樹，建立基于組學數(shù)據(jù)的微生物分類“金標準”。(記者 馮麗妃)

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